Soutenance de thèse de Phimpha PABORIBOUNE

Surveillance des hépatites virales B-C au Laos ; De l’analyse de routine à la recherche de biomarqueurs par métabolomique


Titre anglais : The surveillance of viral hepatitis B and C in Lao PDR; from routine analysis toward to research of biomarkers by metabolomics methods
Ecole Doctorale : BSB - Biologie, Santé, Biotechnologies
Spécialité : Physiopathologie
Etablissement : Université de Toulouse
Unité de recherche : UMR 152 - PHARMA-DEV -Laboratoire Pharmacochimie et Pharmacologie pour le Développement


Cette soutenance a eu lieu jeudi 06 décembre 2018 à 14h00
Adresse de la soutenance : Faculté de Pharmacie, 35 Chemin des Maraîchers, 31400 Toulouse - salle salle du conseil, coque D, 1er étage

devant le jury composé de :
Eric DEHARO   CR1   UMR 152 - PHARMA-DEV   Directeur de thèse
Françoise  NEPVEU   Professeur   UPS, Faculté de Pharmacie-Université Paul Sabatier-Toulouse III   Examinateur
Paul  DéNY   Professeur   Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Hôpitaux Universitaires Paris Seine Saint Denis, service microbiologie clinique   Examinateur
François-Xavier BABIN   Directeur du Développement International   Fondation Mérieux   Examinateur
Pierre-Marie PREUX   Professeur   UMR 1094 Inserm Neuroépidémiologie Tropicale (NET)   Rapporteur
Daniel AJZENBERG   CR2   Université de Limoges, Faculté de Médecine, UMR 1094 NET   Rapporteur


Résumé de la thèse en français :  

Les travaux exposés dans cette thèse sont le reflet d’années d’efforts consacrées à la mise en place de diagnostics de qualités des hépatites virales au Laos au sein du Centre d’infectiologie Lao Christophe Mérieux (CILM), dont je suis aujourd’hui la directrice scientifique.
En introduction, nous avons tenu à présenter les caractéristiques socio-économiques du Laos et ses défis sanitaires pour atteindre les Millennium Development Goals, qui guident les politiques publiques de pays en situation de développement. Nous avons jugé important de souligner ces points tout comme la présentation du CILM pour faire comprendre au lecteur le contexte de réalisation de ce travail.
C’est grâce à une biobanque riche de plus de 7,000 échantillons biologiques de patients infectés par les virus des hépatites virales B et C, que nous avons pu poser la question de recherche clé de cette thèse :
Comment évoluent les hépatites virales chez les patients reçus depuis une dizaine d’années au CILM ?
Cette question en a fait émerger une deuxième concernant la qualité du diagnostic dans les centres de soins à Vientiane. Ainsi, nous nous sommes intéressés aux kits de diagnostic rapide de l’hépatite B utilisés dans les structures de soins de Vientiane, comparés au standard utilisé dans notre laboratoire.
Ces travaux ont donné lieu à la publication de 2 articles (un troisième article a été soumis), jouent un rôle capital pour le pays car ils donnent des axes d’intervention aux autorités de santé publique laotiennes pour combattre ce fléau.
Nous avons choisi une présentation dichotomique des hépatites virales avec une partie dédiée aux hépatites B et une partie dédiée à l’hépatite C en raison de l’émergence d’une troisième question de recherche plus fondamentale qui concerne le risque de développement du cancer du foie chez les patients infectés, risque différent suivant que l’on est porteur d’une hépatite B ou d’une C.
En effet, les outils diagnostiques pour déterminer la magnitude de ce risque ne sont pas ou peu accessibles pour les patients au Laos. C’est la raison pour laquelle la dernière partie de notre travail a porté sur la recherche de marqueurs potentiels de cette transition pathologique par des techniques de métabolomique appliquées aux deux types d’infection. La possibilité d’accéder à une bio-banque de milliers de sérums accumulés au fil des ans est un des atouts de notre laboratoire pour satisfaire cette démarche scientifique. Nos résultats bien que préliminaires différencient bien les deux types d’infection. Ils ouvrent la voie vers de nouveaux horizons diagnostiques et seront poursuivis dans le cadre d’un projet Européen Marie Sklodowska-Curie Actions – Research and Innovation Staff Exchange.

 
Résumé de la thèse en anglais:  

The work presented in this thesis reflects years of effort devoted to the implementation of quality diagnostics of viral hepatitis in Laos at the Centre d'infectiologie Lao Christophe Mérieux (CILM), of which I am now the scientific director.
In the introduction, we wanted to present the socio-economic characteristics of Laos and its health challenges in order to achieve the Millennium Development Goals, which guide public policies in developing countries. We felt it was important to highlight these points as well as the presentation of the MILC to help the reader understand the context in which this work was carried out.
It is thanks to a biobank with more than 7,000 biological samples from patients infected with viral hepatitis B and C viruses, that we were able to ask the key research question of this thesis:
How do viral hepatitis evolve in patients who have been treated at the MILC for the past ten years or so?
This question raised a second one concerning the quality of diagnosis in health centres in Vientiane. For example, we were interested in the hepatitis B rapid diagnostic kits used in Vientiane's health facilities, compared to the standard used in our laboratory.
This work has resulted in the publication of 2 articles (a third article has been submitted), and plays a crucial role for the country because it provides Laotian public health authorities with a focus for action to combat this scourge.
We have chosen a dichotomous presentation of viral hepatitis with a section dedicated to hepatitis B and a section dedicated to hepatitis C because of the emergence of a third more fundamental research question concerning the risk of developing liver cancer in infected patients, a risk that differs according to whether one is a carrier of hepatitis B or C.
Indeed, diagnostic tools to determine the magnitude of this risk are not or only slightly accessible for patients in Laos. This is why the last part of our work focused on the search for potential markers of this pathological transition using metabolomic techniques applied to both types of infection. The possibility of accessing a bio-bank of thousands of sera accumulated over the years is one of our laboratory's assets to satisfy this scientific approach. Our results, although preliminary, clearly differentiate between the two types of infection. They pave the way for new diagnostic horizons and will be pursued as part of a European project Marie Sklodowska-Curie Actions - Research and Innovation Staff Exchange

Translated with www.DeepL.com/Translator

Mots clés en français :Métabolomique,Biomarqueurs,Surveillance,hépatites B et C,routine,analyse
Mots clés en anglais :   Metabolomic,Biomarkers,Surveillance,Hepatitis B and C,routine,analysis