Soutenance de thèse de Jade BRUXAUX

phylogénie et évolution des pigeons et tourterelles (columbidae) à différentes échelles de temps et d'espace


Titre anglais : phylogeny and evolution of pigeons and doves (columbidae) at different space and time scales
Ecole Doctorale : SEVAB - Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques et Bioingenieries
Spécialité : Ecologie, biodiversité et évolution
Etablissement : Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse
Unité de recherche : UMR 5174 - EDB - Evolution et Diversité Biologique


Cette soutenance a eu lieu jeudi 08 mars 2018 à 9h30
Adresse de la soutenance : Université Toulouse III Paul Sabatier 118 route de Narbonne 31062 TOULOUSE CEDEX 9 - salle Amphithéâtre Schwartz

devant le jury composé de :
Christophe THéBAUD   Professeur   Université Toulouse III Paul Sabatier   CoDirecteur de thèse
Emmanuel DOUZERY   Professeur   Université de Montpellier   Rapporteur
Marianne ELIAS   Directeur de Recherche   Muséum National d'Histoire Naturelle   Rapporteur
Pierre-André CROCHET   Directeur de Recherche   CNRS   Examinateur
Guillaume BESNARD   Chargé de Recherche   CNRS   CoDirecteur de thèse
Alice CIBOIS   Chargé de Recherche   Muséum de Genève   Examinateur
Céline BROCHIER-ARMANET   Professeur   Université Claude Bernard Lyon 1   Examinateur


Résumé de la thèse en français :  

La diversification de la famille des Columbidae s’est probablement déroulée entre le milieu de l’Eocène et le milieu du Miocène, où tous les clades actuels étaient déjà apparus. Deux événements indépendants de dispersion depuis les Amériques vers les Philippines et la Wallacea semblent avoir précédé la dispersion des espèces dans les régions adjacentes. Ces dispersions à longue distance peuvent avoir eu lieu vers l’Afrique par l’intermédiaire d’îles présentes dans l’Atlantique Sud, puis vers l’Inde par des îles présentes dans l’Océan Indien. Celles-ci pourraient avoir également permis des mouvements depuis la Nouvelle-Guinée et la Wallacea vers l’Afrique, Madagascar et les Mascareignes, poussés par des vents et courants suivant cette direction. A l’inverse, les îles ne semblent pas avoir joué un rôle majeur dans le processus de diversification de la famille, avec des taux de spéciation non proportionnels au taux d’insularité. Malgré tout, la diversité maximale au sein de la famille est atteinte dans la région des Philippines, de la Wallacea et de l’Australasie, régions particulièrement riches en îles. La Nouvelle-Guinée, en particulier, héberge une diversité considérable, avec 20 espèces pouvant coexister dans certaines localités. Les columbidés les plus gros, qui appartiennent au genre Goura (pigeons couronnés), sont endémiques de cette île. Leur diversification a probablement commencé au sein même de l’île, il y a environ 5.73 millions d’années. Des événements géologiques tels que l’orogénie de la cordillère centrale ont probablement joué un rôle important en partageant la distribution de l’espèce ancestrale. Des dispersions par-delà des barrières géographiques établies peuvent ensuite avoir permis l’établissement de population isolées et entrainé leur diversification. Les hypothèses phylogénétiques produites ici à partir d’échantillons de musée permettront de répondre à de nombreuses questions sur la biogéographie et la diversification des Columbidae.

 
Résumé de la thèse en anglais:  

Diversification of the Columbidae family probably took place between mid-Eocene and mid-Miocene, where all extant clades were already established. Two independent dispersal events seem to have occurred between New World and Philippines / Wallacea before surrounding dispersals. These dispersions would have taken place thanks to stepping-stones movement through South Atlantic islands to Africa, and subsequently to India. These islands could also explain movements from New Guinea and Wallacea to Africa, Madagascar and Mascareignes, which are supported by winds and currents. On the other side, islands do not seem to have played a so important role in diversification, with speciation rates varying following a normal distribution, more than a model depending of insularity. Nevertheless, the highest Columbidae species-richness is reached in Philippines, Wallacea and Australasia, regions especially rich in islands. New Guinea, in particular, hosts an impressive diversity, with up to 20 species co-occurring in some places. The biggest Columbidae, belonging to the genus Goura (crowned pigeons), are endemic to this island. Our analyses suggest that their diversification probably started within New Guinea around 5.73 Ma. Geological events such as the cordillera orogeny probably played a major role by splitting ancestral distribution, while more recent dispersals over barriers may have also led to the settlement of isolated populations that promoted diversification. This work allowed the generation of phylogenetic hypotheses from museum samples, which will allow answering numerous questions regarding Columbidae biogeography and diversification.

Mots clés en français :Evolution,Biogéographie,Génomique,Phylogénie,Columbidae
Mots clés en anglais :   Evolution,Biogeography,Genomics,Phylogeny,Columbidae