Dans les années 2000 il a été démontré que la formation biochimique des liens peptidiques est catalysé par la partie nucléique des Ribosomes in vivo. L'activité catalytique des ARN est due au repliement de ces derniers en de complexes structures secondaires et grâce à la présence du OH en 2'.« Just think what RNA could do if it possessed an imidazole side chain like histidine, a carboxy group like glutamic acid or a sulfhydryl group like cysteine//…// if RNA is to be pitied for its lack of chemical functionality, then what are we to say about DNA?» (G.F. Joyce, 1998, 95, 5845). Comme pour les RNAzymes, certains DNAzymes ont été sélectionnés in vitro par approche SELEX capables de réaliser des coupures phosphodiesterases, ou de réaction de Diels Alder et aldolization par exemple. Notre objectif est de étendre le concept d'acides nucleiques catalytiques à un nouveau DNAzyme capable de recréer le site catalytique responsable des coupures des liens peptidiques des protéases à serine. Pour cela une jonction trois voies portant des fonctionnalité qui rappellent les chaines latérales des acides aminés de la triade catalytique a été obtenue de manière à mimer l'activité des protéases. La synthèse et les études physico-chimiques sont présentés. |
In the 2000, it was demonstrated that biochemical peptide bond formation is catalysed by ribonucleic acids moieties in ribosomes in vivo. RNA accesses catalytic activity through secondary structure folding due to the presence of 2’OH. And what about DNA?
« Just think what RNA could do if it possessed an imidazole side chain like histidine, a carboxy group like glutamic acid or a sulfhydryl group like cysteine//…// if RNA is to be pitied for its lack of chemical functionality, then what are we to say about DNA?» (G.F. Joyce, 1998, 95, 5845) Like for RNAzyme, some DNAzymes have been selected in vitro by SELEX approach to realize phosphodiesterase cleavage, or perform Diels-Alder or aldolization reactions for example. Our proposal is to extend the concept of catalytic acids to a novel DNAzyme able to reproduce the catalytic site responsible of the cleavage of the peptide bond within a serine protease enzyme. A three-way junction bearing amino acids side chain like functionalities has been obtained to mimic the serine protease triad. Its synthesis and physico-chemical analyses are presented. The aim of this work is to obtain an oligonucleotide-based structure able to catalyze peptide bond hydrolysis like serine enzymes. |