Soutenance de thèse de YANG LIU

Influence de la méiofaune sur les fonctions du biofilm en relation avec la qualité de l'eau de rivière


Titre anglais : Influence of meiofaunal invertebrates on biofilm function related to water quality of rivers
Ecole Doctorale : SDU2E - Sciences de l'Univers, de l'Environnement et de l'Espace
Spécialité : Ecologie fonctionnelle
Etablissement : Université de Toulouse
Unité de recherche : UMR 5245 - Laboratoire écologie fonctionnelle et environnement
Direction de thèse : Michèle TACKX
Co-encadrement de thèse : Evelyne BUFFAN-DUBAU


Cette soutenance a eu lieu jeudi 19 novembre 2015 à 14h00
Adresse de la soutenance : 4R1, Universite Paul Sabatier, 118 Route de Narbonne, Toulouse, 31077 - salle 5

devant le jury composé de :
Michèle TACKX   Pr   Université Paul Sabatier   Rapporteur
Evelyne BUFFAN-DUBAU   MCF   Université Paul Sabatier   Rapporteur
ISABEL MUÑOZ GRACIA   Pr   Universitat de Barcelona   Rapporteur
Christine DUPUY   Pr   Université de La Rochelle   Rapporteur
Rutger DE WIT   DR   Université de Montpellier   Examinateur
Emilie LYAUTEY   MCF   Université Savoie Mont Blanc   Examinateur
Alain DAUTA   CR   Université Paul Sabatier   Examinateur
Magali GERINO   Pr   Université Paul Sabatier   Examinateur


Résumé de la thèse en français :  

Le rôle de la méiofaune sur le fonctionnement des biofilms lotiques a été examiné par l’étude de son effet potentiel sur la capacité de consommation de l’azote des biofilms, au cours de quatre expérimentations. Les deux premières (Chapitres 2 et 3) concernent les biofilms épilithiques (phototrophes) tandis que les deux autres ont porté sur les biofilms (hétérotrophes) de la zone hyporhéique. Les biofilms sont soumis (1) à différents niveaux de densités (méiofaune) et à un enrichissement en nutriments ou (2) à différents niveaux de diversité (biofilm/méiofaune/macrofaune). Une partie des microcosmes présentant chaque niveau de diversité a été exposée à l’effet d’un herbicide, le diuron. Dans l’ensemble, la méiofaune associée aux biofilms des microcosmes était largement dominée par les rotifères. Les résultats basés sur les biofilms phototrophes montrent que les rotifères peuvent répondre à court terme, à un enrichissement en N-NO3 par une augmentation significative de leur densité et biomasse. De plus, le taux de consommation de N-NO3 est apparu significativement plus élevé dans les microcosmes dont les densités de méiofaune étaient les plus élevées. Cet effet positif de la méiofaune sur la consommation de N- NO3 par les biofilms a été retrouvé dans l’étude basée sur le biofilm hyporhéique pour les microcosmes non soumis aux effets du diuron. Dans l’ensemble, ce travail met donc en évidence le rôle significatif que peut avoir la méiofaune dans les processus de consommation de l’azote par les biofilms lotiques. De plus, les résultats suggèrent fortement que les invertébrés interagissent avec les micro-organismes impliqués dans les processus de réduction des concentrations en azote, dans le biofilm phototrophe comme dans le biofilm hyporhéique. Enfin, l’exposition à l’herbicide a engendré une modification significative du taux de consommation de N-NO3 dans les microcosmes hyporhéiques. Cependant, la comparaison du taux de consommation moyen de N-NO3 entre les traitements exposés à l’herbicide et ceux non exposés, a montré que la présence des invertébrés (méiofaune + macrobenthos) a significativement réduit l’effet du diuron sur ces processus. Cette étude met en exergue le rôle potentiellement important des interactions micro- organismes – invertébrés dans (1) le cycle de l’azote des biofilms et donc, dans les fonctions relatives à leur contribution aux processus « d’auto-épuration » des cours d’eau, et (2), dans la capacité de résistance des écosystèmes hyporhéiques face aux perturbations chimiques.

 
Résumé de la thèse en anglais:  

The role of meiofauna on the functioning of riverine biofilms was examined by studying their potential effect on nitrogen consumption capacity of biofilms in four experiments (Chapters 2 and 3: epilithic phototrophic biofilms; Chapters 4 and 5: heterotrophic biofilms of hyporheic zone). Biofilms are subjected to (1) different levels of densities (meiofauna) and nutrient enrichment or (2) different levels of diversity (biofilm/meiofauna/macrofauna). A part of the microcosms of each level of diversity was exposed to the effect of an herbicide, diuron. Overall, biofilm-associated meiofauna in microcosms was dominated by rotifers. Results in phototrophic biofilms showed that the response of rotifers to short-term nutrient enrichment was significant increases in their density and biomass. In addition, N-NO3 uptake rates appeared significantly higher in microcosms with highest meiofauna densities. This positive effect of meiofauna on biofilm N-NO3 uptake was also found in hyporheic biofilm microcosms, but not under the effect of diuron. Therefore, this thesis highlights that meiofauna can have a significant role in nitrogen consumption processes by lotic biofilms. In addition, the results strongly suggest that invertebrates interact with microorganisms involved in the reduction processes of nitrogen concentrations in the phototrophic biofilm as well as the hyporheic biofilm. Finally, the herbicide exposure resulted in a significant modification of N-NO3 uptake rate in hyporheic microcosms. However, the comparison of the average N- NO3 uptake rate between treatments exposed to herbicide and those unexposed, showed that the presence of invertebrates (meiofauna + macrofauna) significantly reduced the effect of diuron on these processes. This study highlights the potentially important role of microorganism-invertebrate interactions (1) in the nitrogen cycle of biofilms and thus functions related to their contribution to the “self-purification” process in streams, and (2) in resilient capacity of the hyporheic ecosystem to chemical perturbations.

Mots clés en français :Biofilm phototrophe de rivière, méiofaune, cyanobactéries, diatomées, qualité de l'eau, rivières,
Mots clés en anglais :   Phototrophic biofilm finction, Meiofaunal activity, cyanobacteria, diatoms, water quality, river,