Le Calotriton des Pyrénées (Calotriton asper) est un amphibien endémique du massif pyrénéen (Andorre, Espagne et France) aux préférences écologiques encore mal connues. Cette espèce, classée vulnérable sur la liste rouge des amphibiens de France métropolitaine, est localement soumise à un risque élevé d’extinction. Améliorer les connaissances concernant son écologie est nécessaire pour améliorer le processus de prise de décision concernant la conservation de cette espèce. Les objectifs de cette thèse de doctorat étaient donc de mieux comprendre les facteurs déterminant sa présence dans les cours d'eau à différentes échelles spatiales, d'estimer certains paramètres de base de population et d’apréhender l'utilisation de l'espace du Calotriton des Pyrénées.
A l’échelle de l’aire de répartition dans les Pyrénées françaises, un modèle de distribution d’espèce permettant de coupler des données d’occurrence à des facteurs environnementaux a été utilisé afin de prédire la qualité des habitats et fournir une carte de prédiction de présence de l’espèce. Afin d’évaluer plus finement les préférences écologiques du Calotriton des Pyrénées, nous nous sommes intéressés à l’influence de variables environnementales locales (e.g. substrat minéral, faciès d’écoulement) sur son abondance dans 6 tronçons de cours d’eau pyrénéens. A cette échelle spatiale nous avons également étudié les densités de population, évalué la taille des domaines vitaux et exploré les probabilités de déplacements des individus. Pour cela une méthode de reconnaissance individuelle basée sur les patrons de coloration ventraux a été testée et validée, puis utilisée pour le suivi 3 populations de Calotriton sur 3 années.
Les principaux résultats montrent qu’à l’échelle de l’aire de répartition du Calotriton des Pyrénées, la distribution de l’espèce est principalement déterminée par les températures maximales, le pourcentage d’agriculture dans le lit majeur, ainsi que par l’intensité des périodes d’assec dans les rivières. A l’échelle du tronçon de cours d’eau, nous avons pu mettre en évidence des tailles de domaines vitaux réduites, et une préférence pour des habitats avec une quantité intermédiaire de substrat minéral grossier. Les populations de Calotriton des Pyrénées semblent par ailleurs être de taille relativement importantes dans les cours d’eau qui leurs sont favorables. Dans un contexte de changement climatique et de pressions anthropiques grandissantes, les connaissances apportées par cette thèse devraient permettre de mieux considérer cette espèce endémique, d’intérêt patrimonial, dans les plans de gestion des milieux aquatiques pyrénéens. |
The Pyrenean brook newt (Calotriton asper) is an amphibian endemic to the Pyrenees (Andorra, Spain and France), with ecological preferences that are still poorly understood. This species, classified as vulnerable in the national Red List of amphibians of metropolitan France, is locally exposed to high extinction risk. Fill gaps in knowledge concerning its ecology is necessary to improve the conservation decision making process of this species. The objectives of this PhD thesis were thus to better understand the factors driving its presence in streams at different spatial scales and to estimate basic parameters of population and space-use of the Pyrenean brook newt.
At the scale of its distribution range in the French Pyrenees, we used species distribution modelling to couple occurence data with environmental factors to predict habitat quality and provide presence prediction map for this species. In order to further assess the ecological preferences of the Pyrenean brook newt, we studied the influence of local environmental variables (e.g. mineral substrate, flow facies) on its abundance in six Pyrenean streams reaches. At this spatial scale, we also assessed population densities and home range sizes, and we explored the probability of movements of individuals. As part of the present research, development and validatation of individual recognition methodology based on ventral coloration patterns was tested and used for monitoring 3 populations over 3 years.
Main results show that at the scale of the Pyrenean brook newt range, the species distribution is mainly determined by maximum temperatures, percentage of agriculture around the stream, and frequency of zero-flow events. At the stream reach scale, we found small home range sizes and a preference for habitats with an intermediate amount of coarse mineral substrate. The Pyrenean brook newt populations also appear to be relatively large in favourable streams. In a context of climate change and increasing anthropic pressures, the understanding of ecological parameters of Pyrenean brook newt provided by this PhD thesis should enable to better consider this endemic species with heritage interest, in management plans of Pyrenean aquatic environments.
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