Agata RACZYŃSKA - Admise au titre de docteur

Identifiant ORCID 0000000218843669
Compte LinkedIn https://www.linkedin.com/in/agata-raczy%C5%84ska-554234161/
Compte Researchgate https://www.researchgate.net/profile/Agata_Raczynska

Projet professionnel :

Enseignement et recherche, enseignement supérieur
Recherche en milieu académique
Recherche en entreprise, R&D du secteur privé
Pilotage de la recherche et de l’innovation, gestion de projets innovants, pilotage de structures innovantes
Métiers d’accompagnement et de support à la recherche, à l’innovation et à la valorisation, au développement des Spin Off et Start-up innovantes

Techniques maîtrisées :
simulations dynamiques moléculaires AMBER, docking moléculaire, programmation: R, Python, Matlab, bioinformatique, analyse de données, science des données, Rosetta
Compétences :
Gestion du temps, auto-motivation, langues étrangères, travail d'équipe, persévérance

Expérience professionnelle :
En recherche d'emploi depuis le 23 août 2022

Doctorat Ingénieries microbienne et enzymatique

Thèse soutenue le 7 mars 2025 - Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse

Ecole doctorale : SEVAB - Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques et Bioingenieries

Sujet : Biodégradation de polymères synthétiques à l'aide d'enzymes

Mots-clés de la thèse : Biodégradation des plastiques,Dégradation enzymatique,Polyuréthane,Cutinase,Ingénierie des enzymesmoléculaire,Modélisation moléculaire,

Direction de thèse : Isabelle ANDRE

Co-direction de thèse : Artur Góra

Cotutelle Politechnika Śląska / Silesian University of Technology POLOGNE
Descriptif : 3 séjours de 4 mois en France (12 mois au total)

Unité de recherche : TBI - Toulouse Biotechnology Institute, Bio & Chemical Engineering UMR 5504 - Toulouse

Master - Master of Science in Engineering, M.Sc.Eng.

obtenu en septembre 2020 - Politechnika Śląska / Silesian University of Technology
Option : biotechnologie, bioinformatique

Production scientifique

- Agata Raczyńska, Artur Góra, Isabelle André 2024. An overview on polyurethane-degrading enzymes Biotechnology Advances, -, https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2024.108439
- Acevedo-rocha, Carlos Bakshi, Amulyasai Bornscheuer, Uwe T Campopiano, Dominic J Civi, Janko Ehinger, Friedrich Johannes Gomm, Andrew Artur, G Green, Anthony P Hanzevacki, Marko Harvey, Jeremy N Hilvert, Donald Huang, Meilan Jarvis, Amanda Caroline, Shina Kamerlin, Lynn Lichtenstein, Bruce R Luk, Louis Y P Lutz, Stefan Marsh, E Neil G Mckenzie, Alexander Moliner, Vicent Mulholland, Adrian Pelletier, Joelle N Raczy, Agata Stockinger, Peter Rao, Aditya Gopalakrishna Rhys, Guto Roelfes, Gerard Szleper, Katarzyna Thompson, Sean Adeoti Turner, Nicholas Kamp, Marc Van Der Xu, Guangcai Zeymer, Cathleen 2024. Artificial, biomimetic and hybrid enzymes: general discussion Faraday Discussions, -, 10.1039/d4fd90024c
- Abdulrahman Alogaidi, Fraser Armstrong, Amulyasai Bakshi, Uwe T. Bornscheuer, Gareth Brown, Isabelle Bruton, Dominic J. Campopiano, Daniel Dourado, Friedrich Johannes Ehinger, Sabine Flitsch, Artur Góra, Anthony P. Green, Donald Hilvert, Sumire Honda, Meilan Huang, Rhiannon E. H. Jones, Thomas King, Bruce R. Lichtenstein, Michal Lihan, Louis Y. P. Luk, Tara C. Lurshay, Stefan Lutz, E. Neil G. Marsh, Alexander McKenzie, Ben Orton, Joelle N. Pelletier, Agata Raczyńska, Lubomír Rulíšek, Peter Stockinger, Per-Olof Syrén, Nicholas Turner, Francesca Valetti, Marc Van der Kamp, Lu Shin Wong 2024. Biocatalysis for industry, medicine and the circular economy: general discussion Faraday Discussions, -, https://doi.org/10.1039/D4FD90025A
- Abramiuk, Magdalena Acevedo-rocha, Carlos Alogaidi, Abdulrahman Armstrong, Fraser Bakshi, Amulyasai Bornscheuer, Uwe T Campopiano, Dominic J Chaiyen, Pimchai Ehinger, Friedrich Johannes Flitsch, Sabine Harvey, Jeremy N Hilvert, Donald Jarvis, Amanda G Jones, Rhiannon Lichtenstein, Bruce R Luk, Louis Y P Lurshay, Tara C Malcomson, Thomas Marsh, E Neil G Mcfarlane, Neil R Mckenzie, Alexander Megarity, Clare F Moliner, Vicent Mulholland, Adrian J Orton, Ben Pelletier, Joelle N Raczy, Agata Thompson, Sean Adeoti Turner, Nicholas Valetti, Francesca Wong, Lu Shin Zeymer, Cathleen 2024. Biocatalytic pathways, cascades, cells and systems: general discussion Faraday Discussions, -, 10.1039/d4fd90023e
- Carlos Acevedo-Rocha, Lukasz Berlicki, Uwe T. Bornscheuer, Dominic J. Campopiano, Pimchai Chaiyen, Janko Čivić, Zhiqi Cong, Friedrich Johannes Ehinger, Sabine Flitsch, Artur Góra, Marko Hanzevacki, Jeremy N. Harvey, Donald Hilvert, Florian Hollfelder, Amanda G. Jarvis, Bruce R. Lichtenstein, Stefan Lutz, Thomas Malcomson, E. Neil G. Marsh, Neil R. McFarlane, Alexander McKenzie, Adrian Mulholland, Sílvia Osuna, Joelle N. Pelletier, Agata Raczyńska, Gerard Roelfes, Lubomír Rulíšek, Peter Stockinger, Nicholas Turner, Francesca Valetti, Marc Van der Kamp, Mikael Widersten, Cathleen Zeymer 2024. Enzyme evolution, engineering and design: mechanism and dynamics: general discussion Faraday Discussions, -, DOI https://doi.org/10.1039/D4FD90022G
- Agata Raczyńska 2024. Highlights from the Biocatalysis Faraday Discussion, May 2024, London, United Kingdom Chemical Communications, 76, DOI https://doi.org/10.1039/D4CC90306D
- Katarzyna Szleper, Artur Góra, Agata Raczyńska 2024. Pur-Gen: A Web Server for Automated Generation of Polyurethane Fragment Libraries Polymer Degradation and Stability, -, 10.2139/ssrn.4876817
- Agata Raczyńska, Patryk Kapica, Katarzyna Papaj, Agnieszka Stańczak, Divine Shyntum, Patrycja Spychalska, Anna Byczek-Wyrostek, Artur Góra 2023. Transient binding sites at the surface of haloalkane dehalogenase LinB as locations for fine-tuning enzymatic activity PLOS ONE, 21, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0280776
- Bzówka M., Mitusińska K., Raczyńska A., Skalski, T., Samol A., Bagrowska, W., Magdziarz, T., Góra A. 2022. Evolution of tunnels in α/β-hydrolase fold proteins - what can we learn from studying epoxide hydrolases? PLoS Computational Biology, 1-16, doi:10.1371/journal.pcbi.1010119
- Mitusińska K., Raczyńska A., Wojsa P., Bzówka M., Góra A. 2021. AQUA-DUCT: Analysis of Molecular Dynamics Simulations of Macromolecules with the Use of Molecular Probes [Article v1.0] Living Journal of Computational Molecular Science, Living J. Comp. Mol. Sci. 2021, 2(1), 21383, https://doi.org/10.33011/livecoms.2.1.21383
- Mitusińska K., Wojsa P., Bzówka M., Raczyńska A., Bagrowska W., Samol A., Kapica P., Góra A. 2021. Structure-function relationship between soluble epoxide hydrolases structure and their tunnel network Computational and Structural Biotechnology Journal, Volume 20, 2022, Pages 193-205, https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.10.042
- Mitusińska K., Raczyńska A., Bzówka M., Bagrowska W., Góra A 2020. Applications of water molecules for analysis of macromolecule properties Computational and Structural Biotechnology Journal, Computational and Structural Biotechnology Journal 2020, 18, 355-365, 10.1016/j.csbj.2020.02.001
- Bzówka M., Mitusińska K., Raczyńska A., Samol A., Tuszyński J.A., Góra A. 2020. Structural and Evolutionary Analysis Indicate That the SARS-CoV-2 Mpro Is a Challenging Target for Small-Molecule Inhibitor Design International Journal of Molecular Sciences, Int. J. Mol. Sci. 2020, 21(9), 3099, https://www.mdpi.com/1422-0067/21/9/3099
- Magdziarz, T.; Mitusińska, K.; Bzówka, M.; Raczyńska, A.; Stańczak, A.; Banas, M.; Bagrowska, W.; Góra, A. 2019. AQUA-DUCT 1.0: structural and functional analysis of macromolecules from an intramolecular voids perspective Bioinformatics, Bioinformatics 2019, 1-3, https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/8/2599/5682414
- Płuciennik, A.; Stolarczyk, M.; Bzówka, M.; Raczyńska, A.; Magdziarz, T.; Góra, A. 2018. BALCONY: An R package for MSA and functional compartments of protein variability analysis BMC Bioinformatics, 8 pages, https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-018-2294-z

Langues Vivantes : Allemand B1 - Intermédiaire - Français C2 - Maternel - Anglais C2 - Maternel - Polonais C2 - Maternel

Dernière mise à jour le 13 février 2025