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MOOC : Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente

Contact :
Ecole des Docteurs
docteur-metier@univ-toulouse.fr
Catégorie :
Éthique et intégrité scientifique
Nombre d'heures :
 6
Max participants :
 400
Public prioritaire :
 Aucun
Public concerné :
  Tout doctorant de Toulouse
Lieu :
A distance
Langue de l'intervention :
français
Observations :
 Cours bilingue français/anglais
Modalités d'inscription :
Pour valider le MOOC, il vous faudra déposer le CERTIFICAT DE FORMATION délivré sur la plateforme FunMOOC sur votre Espace Personnel ADUM et remplir le questionnaire d'évaluation qualité que vous recevrez par mail.

Objectifs :

À la fin de ce cours, vous saurez :
- Comprendre les enjeux et les difficultés de la recherche reproductible
- Découvrir des outils pour améliorer sa prise de notes, sa gestion des données, et des calculs
- Se familiariser avec un outil de suivi de gestion de version (Gitlab)
- Se familiariser avec les documents computationnels réplicables (Jupyter, RStudio ou Org-Mode)
- Écrire un notebook pour combiner efficacement une analyse de données et sa documentation.

Programme :

Ce Mooc propose des principes méthodologiques pour une science ouverte et transparente. Il aborde de manière pratique la prise de notes, le document computationnel, la réplicabilité des analyses.

Vous prenez des notes et vous voulez vous y retrouver ? Vous faites des calculs sur ordinateur et vos résultats changent d’un jour à l’autre ? Vous aimeriez partager avec vos collègues vos analyses de données et vos derniers travaux et qu’ils puissent les réutiliser ?

Ce Mooc est pour vous, doctorant-e-s de toutes disciplines qui souhaitez vous former à des environnements de publication et des outils fiables :

- Markdown pour la prise de note structurée
- des Outils d'indexation (DocFetcher et ExifTool)
- Gitlab pour le suivi de version et le travail collaboratif
- Notebooks (jupyter, rstudio ou org-mode) pour combiner efficacement calcul, représentation et analyse des données

Vous apprendrez au cours des exercices basés sur des cas pratiques à utiliser ces outils pour améliorer votre prise de notes, votre gestion des données et des calculs. Pour cela, vous disposerez d'un espace Gitlab et d'un espace Jupyter, intégrés à la plateforme FUN et qui ne nécessitent aucune installation. Ceux qui le souhaitent pourront réaliser les travaux pratiques avec Rstudio ou Org-mode après avoir installé ces outils sur leur machine. Toutes les procédures d'installation et de configuration des outils sont fournies dans le Mooc, ainsi que de nombreux tutoriels.

Nous vous présenterons également les enjeux et les difficultés de la recherche reproductible.

La formation participe à l'objectif suivant :

être directement utile pour la rédaction de la thèse ou pour l’exposition écrite ou orale des travaux de recherche

Date de début de la formation : 22 juillet 2024
Inscription : S'inscrire à la formation