M. Sylvain FOISSAC
HDR

sylvain.foissac@inrae.fr
05 61 28 54 31

UMR 1388 - GenPhySE- Unité Génétique, Physiologie et Systèmes d'Elevage
Equipe : REGLISS - Génomique régulationnelle pour les espèces animales

Spécialité : Infectiologie, Physiopathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition

Encadrement :

• 2 thèses en cours
• 1 thèse soutenue / soutenance à venir

Elise JORGE -
Spécialité : Infectiologie, Physiopathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition

Sujet de thèse : Analyse comparative de données de génomique 3D

Mot-clés : génomique 3D,Hi-C,matrice d’interactions,,

Profil mis à jour le 16 juillet 2024        

Victor LEFEBVRE - Spécialité : Biomathématiques, bioinformatique, génomique évolutive

Sujet de thèse : Evolution des paysages régulateurs de l’expression des gènes en lien avec les réarrangements génomiques chez les vertébrés

Mot-clés : régulation,expression,réarrangements génomiques,évolution,phénotypes,contact de chromatine,

Profil mis à jour le 24 février 2025  

Maria MARTI MARIMON -
Savoir faire :
- Compétences en Biologie et Cytogénétique moléculaires.
- Compétences en microscopie confocale (habilitation à la plateforme d’imagerie TRI Genotoul, INRA Castanet Tolosan).
- Compétences en analyse d’image et mesure des distances en 3D (logiciels Volocity et NEMO).
- Compétences en séquençage haut débit (habilitation à la plateforme de séquençage GET-PlaGe, INRA Castanet Tolosan) nécessaires à la construction des librairies pour le séquençage Illumina HiSeq2500.
- Compétences des systèmes d’exploitation libre Linux/Unix et Cluster, nécessaires à l’analyse des données de séquençage (plateforme Bioinfo Genotoul, INRA Castanet Tolosan).


Mobilité géographique : Tous les pays

Spécialité : Pathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition

Sujet de thèse : 3D genome conformation and gene expression in fetal pig muscle at late gestation

Mot-clés : Réseau de co-expression génique,3D DNA FISH,Cartes de contact,Hi-C,Réseau de co-expression génique,

Profil mis à jour le 13 septembre 2018