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M. Stéphane FABRE
HDR
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Coordonnées
:
INRAE, UMR 1388 GenPhySE
Chemin de Borde Rouge BP 52627
31326 CASTANET-TOLOSAN FRANCE
stephane.fabre@inrae.fr
https://genphyse.toulouse.inra.fr
05-61-28-52-01
UMR 1388 - GenPhySE- Unité Génétique, Physiologie et Systèmes d'Elevage
Equipe
: GENESIS - Mécanismes génétiques et épigénétiques de la genèse des phénotypes
Spécialité
: Génétique Moléculaire
Thématiques de recherche
: 1/ Génomique des petits ruminants (mouton, chèvre).
Approches de génétique moléculaire et de génomique, pour la détection de gènes impliqués dans des caractères quantitatifs d'intérêt agronomique : résistance aux maladies, taux d'ovulation, survie des jeunes, vitesse de traite...
2/ Déterminisme génétique de la mono vs polyovulation.
Modèles brebis, truie, vache. Approches de génétique moléculaire et de génomique fonctionnelle.
3/ Génomique fonctionnelle du développement précoce du follicule ovarien chez la brebis.
Analyse des transcriptomes ovocytaire et des cellules de la granulosa par RNASeq pour identifier des transcrits spécifiques des compartiments cellulaires et des variations d'expression au cours du développement précoce du follicule ovarien
Collaborations étroites avec des généticiens quantitatifs, des physiologistes, des bio-informaticiens pour tous ces thèmes de recherche.
Mots clés
: Polymorphisme/QTL , Génomique fonctionnelle , Biologie moléculaire , Petits ruminants
Encadrement :
2 thèses soutenues / soutenances à venir
Maxime BEN BRAIEK -
Spécialité
: Infectiologie, Physiopathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition
Sujet de thèse
: Détection de mutations homozygotes létales chez les petits ruminants.
Mot-clés
: Petits ruminants,génomique,anomalies génétiques,mutations délétères,génétique inverse,
Profil mis à jour le 01 décembre 2022
Louise CHANTEPIE -
Compétences
:
Analyse bibliographique, statistiques (Rstudio), logiciel de gestion de base de données de phénotype et génotype
Savoir faire
:
Biologie cellulaire et moléculaire (clonage, mini-gène, transfection transitoire, culture cellulaire in vitro, analyse des acides nucléiques et des protéine, dosage biologique)
Expérimentation animale (petits ruminants, prélèvements sanguins, phénotypage)
Spécialité
: Pathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition
Sujet de thèse
: Mise en évidence et analyse fonctionnelle des mutations affectant la prolificité des ovins allaitants
Mot-clés
: prolificité,gène majeur,ovin,ovulation,PMSG,reproduction
Profil mis à jour le 15 juin 2020