M. Eric OSWALD
HDR

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UMR 1220 - IRSD - Institut de Recherche en Santé Digestive
Equipe : Pathogénie et Commensalisme des entérobactéries

Thématiques de recherche : Nos études visent à comprendre les interactions entre les bactéries et leur hôte que ce soit l'homme ou l’animal, en étudiant différents pathovars de Escherichia coli, une bactérie qui est à la fois l’une des bactéries aérobies-anaérobies facultatives dominantes de la flore intestinale normale mais aussi un pathogène responsable d’infections intestinales ou extra-intestinales. L'équipe développe une approche multidisciplinaire en microbiologie, biologie moléculaire, immunologie et biologie cellulaire, ainsi que des modèles in vivo, pour étudier:
1 – le mode d'action des facteurs de virulence de E. coli, et plus particulièrement les toxines qui interfèrent avec le cycle cellulaire de la cellule hôte eucaryote et/ou compromettent l'intégrité du génome de l’hôte.
2 – les voies de biosynthèse des génotoxines et des sidérophores bactériens.
3 – l’impact sur la santé de la colonisation (ou d’une infection) avec des souches commensales (ou pathogènes) de E. coli produisant des génotoxines.
4 – la relation entre le microbiote intestinal et la physiopathologie de l’intestin et la réponse immunitaire.
5 – la diffusion/transmission des gènes de résistance aux antibiotiques et des gènes de virulence qui conduisent à l’apparition de bactéries multirésistantes à l’hôpital et à l’émergence de nouveaux clones bactériens pathogènes.
Au travers nos recherches sur les bactéries pathogènes chez homme et l’animal, nous étudions l’étroite frontière entre le commensalisme et la pathogénicité chez E. coli. Pour atteindre cet objectif, nous avons acquis de nouvelles connaissances scientifiques et technologiques dans les différents aspects des infections, de la colonisation intestinale et de l'écologie de E. coli. Les travaux de l'équipe constituent des jalons dans la compréhension de la pathogénie bactérienne, en particulier la découverte et la caractérisation de nouvelles toxines comme CNF, CDT, Cif et la colibactine. Étudier comment ces bactéries pathogènes parviennent à pirater les cellules hôtes est essentiel pour la compréhension des maladies infectieuses, du commensalisme, mais aussi du rôle des bactéries dans la promotion du cancer et des maladies inflammatoires chroniques et dans la susceptibilité aux maladies auto-immunes et aux allergies.

Mots clés : Escherichia coli , pathogénicité , génotoxine

Encadrement :

• 3 thèses en cours ( 2 personnes ne souhaitent pas figurer sur internet)
• 9 thèses soutenues / soutenances à venir (3 personnes ne souhaitent pas figurer sur internet)

Marine COLSON -
Spécialité : Physiopathologie

Sujet de thèse : Étude du rôle des nanoparticules bactériennes dans la virulence et les biothérapies anticancéreuses

Mot-clés : E.coli,vésicule bactérienne,autophagie,inflammation,cancer de la vessie,shiga-toxine

Profil mis à jour le 19 juin 2024            

Nadège BOSSUET -
Expérience professionnelle
Employeur : Pathogénisme et commensalisme des entérobactéries - Toulouse cedex 3 - FRANCE
Fonction : Assistant Ingénieur en techniques biologiques
contrat : 1 décembre 2007

Spécialité : Microbiologie

Sujet de thèse : Étude de la production de colibactine par Escherichia coli en fonction de la concentration en oxygène

Mot-clés : Escherichia coli,oxygène,colibactine,génotoxine,dommage à l'ADN,

Profil mis à jour le 21 novembre 2023      

Nicolas JOUSSERAND -
Spécialité : Physiopathologie

Sujet de thèse : Escherichia coli et infection urinaire du chien et du chat : expression clinique, facteurs de virulence, antibiorésistance et développement d’un moyen de lutte alternatif aux antibiotiques

Mot-clés : infections urinaires du chien et du chat,facteurs de prédisposition,facteurs bactériens de virulence,antibiorésistance,probiotique,Escherichia coli

Profil mis à jour le 24 mars 2021  

MIN TANG -
Spécialité : Microbiologie

Sujet de thèse : Régulation de la production de colibactine chez Escherichia coli

Mot-clés : Escherichia coli,colibactine,îlot pks,polyphosphate kinase,mésalazine,

Profil mis à jour le 26 novembre 2021  

Sophie TRONNET -
Spécialité : Microbiologie

Sujet de thèse : Régulation par le fer et rôle de la colibactine dans la colonisation du tube digestif par Escherichia coli

Mot-clés : Colibactine,E. coli,Fer,microbiote,

Profil mis à jour le 09 décembre 2016  

Christophe GARCIE -
Expérience professionnelle
Employeur : Laboratoire de Bactériologie-Hygiène - TOULOUSE Cedex 9 - FRANCE
Fonction : Assistant Hospitalo-Universitaire
contrat : 2 novembre 2014 - 31 octobre 2016

Spécialité : Microbiologie

Sujet de thèse : Modulation atypique de la biosynthèse de la colibactine, une génotoxine de Escherichia coli, ou comment un îlot génomique est en symbiose avec le chromosome bactérien

Mot-clés : Colibactine,Hsp90,Spermidine,Sidérophores,Virulence,Escherichia coli

Profil mis à jour le 02 octobre 2016      

Delphine PAYROS -
Compétences :
- encadrement de stagiaire M1 en biologie cellulaire et physiologie
- Membre du conseil d'unité du CPTP 1 (centre de physiopathologie toulouse Purpan) U1043 INSERM, Toulouse

Savoir faire :
- Expérimentation animale, titulaire de la formation d'autorisation à expérimenter des animaux de niveau 1 n°311255704
- biologie cellulaire et moléculaire (cultutre primaire, tri, analyse en cytométrie, qPCR, western blot)
- histologie et microscopie (IF et IHCn analyse en microscopie confocale et à fluorescence)
- Microbiologie (transformation bactérienne, dénombrement et caractérisation bactérienne)


Spécialité : Microbiologie

Sujet de thèse : Etude de l'effet de la colonisation des nouveau-nés par des souches de Escherichia coli génotoxiques sur le développement et la fonctionnalité de la barrière intestinale

Mot-clés : Escherichia coli,Génotoxine,Dommage à l'ADN,Microbiote,Maturation intestinale,

Profil mis à jour le Jeudi 11 octobre 2012